Artemis Fowl, un génie de 12 ans, descendant d'une longue lignée de malfaiteurs, cherche désespérément à sauver son père pris en otage. Afin de payer la rançon, il doit infiltrer une ancienne civilisation souterraine : le monde des fées, éblouissant et technologiquement avancé. Son but est de mettre la main sur l'Aculos, l'artefact magique le plus prisé des fées, à la puissance incomparable et qui servira de monnaie d'échange. Pour y arriver, Artémis concocte un plan machiavélique, si dangereux qu'il se retrouvera au coeur d'une guerre des nerfs avec les fées toutes-puissantes.